郁金香‘上农早霞’花色变异相关基因的信息分析

• 作者: 史益敏 唐东芹 杨柳燕 袁媛
• 来源期刊: 上海交通大学学报（农业科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 郁金香 花色 cDNA-AFLP 差异表达
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 9-17
• 页数: 9页
• 分类号: S682.263
• 字数: 5997字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/J.ISSN.1671-9964.2015.02.002

摘要

郁金香(Tulipa fosteriana)红花品种‘上农早霞’是粉花品种‘Albert heijn’的突变种.为探讨两者花色差异的原因,采用cDNA-AFLP技术分析了2品种花瓣中基因的表达差异,共获得371条差异表达的转录衍生片断(transcript-derived fragment,TDFs).通过BLAST比对,75条ESTs与已知蛋白具较高同源性(GenBank登陆号:JZ349173-JZ349247).利用COG、GO和KEGG对其功能和参与的生化途径进行注解,表明这些蛋白具有催化活性、转移酶活性、结合活性等;参与糖类和脂类代谢、信号转导、产物转运等26个生物学过程;涉及新陈代谢、蛋白加工、RNA转运等15个生化途径.选择4个可能与花色变异相关的ESTs(分别编码反转录转座子蛋白、谷胱苷肽S转移酶、类黄酮3’羟化酶以及类胡萝卜素异构酶),应用Real-time PCR技术分析它们在‘上农早霞’和‘Albert heijn’之间的表达差异.结果显示在花朵发育过程中,反转录转座子蛋白以及谷胱苷肽S转移酶基因在‘上农早霞’中的表达水平一直高于‘Albert heijn';类黄酮3’羟化酶基因在‘上农早霞’中几乎没有表达;类胡萝卜素异构酶基因在‘上农早霞’中的表达水平显著低于‘Albert heijn’,由此推测这4个基因或其所在的生化途径与花色变化紧密相关.本研究结果可为进一步分析‘上农早霞’花色变异机理提供参考,为后续花色变化相关基因的克隆提供基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁媛	上海交通大学农业与生物学院	25	135	7.0	10.0
2	唐东芹	上海交通大学农业与生物学院	71	1250	18.0	34.0
3	史益敏	上海交通大学农业与生物学院	45	455	13.0	19.0
4	杨柳燕	上海市农业科学院林木果树研究所	31	42	4.0	5.0