黄瓜绿斑驳病毒河北分离物外壳蛋白基因序列分析及其分组

• 作者: 何乙坤 曹克强 王亚南 王树桐 胡同乐 赵绪生 钟敏
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 黄瓜绿斑驳病毒 外壳蛋白 序列分析 系统进化关系
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 92-97
• 页数: 6页
• 分类号: S436.421
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2015.0017

摘要

为了揭示黄瓜绿斑驳病毒（Cucumber green mottle mosaic virus ，CGMMV）河北分离物分子变异及系统进化情况。本研究自河北省5个代表性西瓜产区采集病样，分离纯化获得5个CGM M V河北分离物，经RT‐PCR扩增、基因克隆获各分离物的外壳蛋白（Coat protein ，CP）基因序列。使用 Vector NTI 10．0软件（Infor‐max ，Frederick ，MD ，USA）和MEGA5．0软件（Koichiro ，Tokyo ，Japan）对河北省5个分离物及GenBank已登录其它分离物CP进行序列分析，构建系统发育树。系统进化关系分析表明：所有CGM M V分离物可划分为5个组，CGM M V河北分离物与中、日、韩三国分离物亲缘关系较近，位于同一组别。与希腊2个分离物（CGM‐MV‐GR5、GR3）亲缘关系最远。CGMMV CP序列相似性分析结果表明：河北省5个分离物CP核苷酸、氨基酸序列相似性在99％～100％之间，与其它17个分离物序列相似性在92％～100％之间。与中国LN及Liaoning两个分离物及韩国Watermelon分离物相似性最高为100％，与希腊2个分离物（GR5、GR3）序列相似性最低为92％～99％。揭示了C G M M V河北分离物的分类地位及其与不同来源分离物之间的遗传进化关系，为进一步研究CGM M V株系划分、基因遗传变异提供了理论基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹克强	河北农业大学植物保护学院	192	2819	27.0	44.0
2	胡同乐	河北农业大学植物保护学院	80	1199	20.0	31.0
3	王树桐	河北农业大学植物保护学院	90	983	17.0	26.0
4	赵绪生	河北农业大学植物保护学院	22	149	8.0	11.0
5	王亚南	河北农业大学植物保护学院	52	489	12.0	19.0
6	何乙坤	河北农业大学植物保护学院	4	12	3.0	3.0
7	钟敏	河北农业大学植物保护学院	5	15	3.0	3.0