牛ATP5B基因启动子与组织差异性表达研究

• 作者: 昝林森 李世军 李安宁 段美艳 王明明 赵志东
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牛ATP5B基因 启动子 实时荧光定量PCR 组织表达
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 382-387
• 页数: 6页
• 分类号: S823.8
• 字数: 4557字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.03.005

摘要

本研究旨在检测前期构建的牛ATP5B基因启动子双荧光素酶报告基因重组质粒在3T3L-1细胞系中的表达活性,检测ATP5B基因在不同组织中的差异表达情况.经脂质体法转染3T3L-1细胞系后,检测7个重组质粒的荧光素酶相对活性,结合生物信息学软件进一步确认牛ATP5B基因可能的核心启动子;利用试剂盒从秦川牛的16个不同组织提取RNA,反转录后,先检测cDNA,再设计ATP5B基因定量引物和1对β-actin内参引物,进行实时荧光定量反应,最后,结合软件比对不同物种的ATP5B基因近端启动子和氨基酸序列.结果,通过转染细胞和荧光素酶活性分析,统计学分析证实重组质粒pATP5B-462荧光素酶活性最高,软件分析所对应的启动子区域-547～-230 bp存在TATA盒、CAAT盒、GATA盒、v-Myb、deltaE这些重要转录调控元件.牛的ATP5B基因组织表达谱结果分析显示,该基因在后腿肌和背最长肌中相对高水平表达,在睾脂、心、瓣胃、皱胃、大肠、小肠、背脂、肾和肝中相对中度表达,在脾、肺、盲肠、瘤胃和网胃中相对微量表达.氨基酸序列比对结果显示,牛ATP5B基因与山羊、绵羊、小鼠、猪和人的ATP5B基因的相似性较高,牛ATP5B基因编码的氨基酸序列与山羊和绵羊的相似性分别高达99％、98％,与人和小鼠的相似性均为96％,与猪的相似性为91％.本研究初步确认了牛ATP5B基因可能的核心启动子,并得到了牛ATP5B基因在16个组织的表达谱结果,软件比对基因序列的结果进一步表明,ATP5B基因是一个较为保守的基因,这为进一步研究牛ATP5B基因的转录调控机制及功能都奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李安宁	西北农林科技大学动物科技学院	9	16	3.0	3.0
2	段美艳	西北农林科技大学动物科技学院	3	6	2.0	2.0
3	赵志东	西北农林科技大学动物科技学院	5	12	2.0	3.0
4	李世军	西北农林科技大学动物科技学院	2	2	1.0	1.0
5	王明明	西北农林科技大学动物科技学院	3	6	2.0	2.0