山羊瘤胃与粪便微生物多样性

• 作者: 徐琴 王立志 王继文 郭伟 闫天海
• 来源期刊: 动物营养学报
• 学科: 农学
• 关键词: 山羊 Illumina MiSeq 瘤胃 粪便 微生物
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 2559-2571
• 页数: 13页
• 分类号: S826
• 字数: 8430字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-267x.2015.08.030

摘要

本试验旨在应用高通量测序技术比较山羊瘤胃和粪便微生物的结构与组成。选取6只10月龄波尔山羊,饲喂精粗比为3∶7的饲粮14 d后采集瘤胃液(R组)和粪便样品(F组)(每组6个重复,每个样品为1个重复)。提取总DNA后用古菌/细菌16S rRNA通用引物扩增V4~V5区,并用 Illumina MiSeq 平台测序。结果表明：1)共获得有效序列227729条,聚类后得13601个运算分类单位(OTU)。2)所得OTU经物种注释99.337%被归类为细菌界,F组相对丰度最高优势菌门为厚壁菌门(65.400%),R组相对丰度最高优势菌门为拟杆菌门(60.188%)。3)从所有样品中共检测到129个科,F组中相对丰度最高为瘤胃球菌科(37.705%),极显著高于R组(P<0.01),而R组中,相对丰度最高的为普雷沃氏菌科(29.959%),极显著高于F组(P<0.01)。4)在粪便样品和瘤胃液样品种共检测到258个属,F组相对丰度最高的属为瘤胃球菌科未分类的属(26.914%),R组相对丰度最高为普雷沃菌属(28.621%)。5)所有12个样品间共发现了14个共享属,其中相对丰度最高的为厚壁菌门下的梭菌属4( Clostridium_Ⅳ,1.748%)。本试验结果表明瘤胃和粪便中微生物组成存在着较大差异,瘤胃中还有许多未被分类鉴定且相对丰度较高的微生物,需要进一步研究。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭伟	四川农业大学动物营养研究所	5	138	5.0	5.0
2	王继文	四川农业大学动物营养研究所	125	673	13.0	21.0
3	王立志	四川农业大学动物营养研究所	41	328	9.0	17.0
4	闫天海	四川农业大学动物营养研究所	4	37	2.0	4.0
5	徐琴	四川农业大学动物营养研究所	4	77	3.0	4.0