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小鼠脑微血管内皮细胞与新生隐球菌 GXM 作用后基因表达谱分析
小鼠脑微血管内皮细胞与新生隐球菌 GXM 作用后基因表达谱分析
作者:
朱红梅
李平
温海
聂舒
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
脑微血管内皮细胞
新生隐球菌
GXM
基因芯片
摘要:
目的:探索新生隐球菌 GXM 能否影响脑微血管内皮细胞基因的表达,为进一步研究隐球菌嗜中枢性的分子机制提供线索。方法使用 Roche NimbleGen 12×135K 小鼠基因表达谱芯片,筛选小鼠脑微血管内皮细胞系 bEnd.3与不同浓度新生隐球菌 GXM 作用后差异表达的基因;结合基因本体论(Gene Ontology),使用 topGO 进行差异基因 GO 分析,结合 GO语义挖掘与隐球菌侵袭中枢神经系统能力相关的差异表达基因的信息;采用荧光实时定量 PCR 对重要基因 PIK3C2G 和ADAMDEC1的表达水平变化加以验证。结果 bEnd.3细胞与新生隐球菌 GXM 作用前后基因表达对比发现,实验组 GXM (90μg/ m)组总共有402个基因表达上调,296个基因表达下调,GXM (180μg/ m)组总共有421个基因表达上调,564个基因表达下调,细胞膜、细胞骨架、磷酸肌醇?3?激酶活化、1?磷酸肌醇?3?激酶活化、细胞紧密连接等生物过程差异表达基因较为富集;对 PIK3C2G 基因和 ADAMDEC1基因表达水平变化进行荧光定量 PCR 验证,结果与芯片结果一致,基因表达水平不同程度上升,且与 GXM 浓度正相关。结论新生隐球菌 GXM 能够影响脑微血管内皮细胞基因表达,PIK3C2G 基因、ADAM?DEC1基因表达上调可能和隐球菌穿越血脑屏障有关。
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文献信息
篇名
小鼠脑微血管内皮细胞与新生隐球菌 GXM 作用后基因表达谱分析
来源期刊
中国真菌学杂志
学科
医学
关键词
脑微血管内皮细胞
新生隐球菌
GXM
基因芯片
年,卷(期)
2015,(2)
所属期刊栏目
论 著
研究方向
页码范围
84-87
页数
4页
分类号
R379.5
字数
3888字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
温海
上海长征医院皮肤病与真菌病研究所全军真菌病重点实验室第二军医大学附属长征医院皮肤科
47
250
9.0
13.0
2
朱红梅
上海长征医院皮肤病与真菌病研究所全军真菌病重点实验室第二军医大学附属长征医院皮肤科
23
98
5.0
9.0
3
李平
上海长征医院皮肤病与真菌病研究所全军真菌病重点实验室第二军医大学附属长征医院皮肤科
5
8
2.0
2.0
4
聂舒
上海长征医院皮肤病与真菌病研究所全军真菌病重点实验室第二军医大学附属长征医院皮肤科
6
34
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节点文献
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新生隐球菌
GXM
基因芯片
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国真菌学杂志
主办单位:
上海长征医院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1673-3827
CN:
31-1960/R
开本:
大16开
出版地:
上海市凤阳路415号
邮发代号:
创刊时间:
2006
语种:
chi
出版文献量(篇)
1639
总下载数(次)
4
总被引数(次)
7106
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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