四川凉山地区烟草黑胫病菌的ITS序列分析

• 作者: 严丹侃 刘东阳 卢军 周本国 张海珊 王勇 王芳 章东方 许大凤 高正良
• 来源期刊: 中国烟草科学
• 关键词: 烟草黑胫病 ITS 寄生疫霉 烟草
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 96-101
• 页数: 6页
• 分类号: S572.09
• 语种: 中文
• DOI: 10.13496/j.issn.1007-5119.2015.01.018

摘要

本研究利用真菌核糖体基因转录间隔区（ITS）通用引物，PCR 扩增四川省凉山州不同地区的20株烟草黑胫病菌的ITS序列，并对PCR产物进行了克隆测序。结果表明，20个供试菌株的ITS1-5.8S-ITS2总长均为803 bp；各菌株之间的ITS序列同源性达到99.3%以上；与GenBank报道的寄生疫霉台湾烟草分离株Phytophthora parasitica（GU111675.1）的同源性在99.6%~100%之间；但各菌株ITS序列的个别位点存在突变，这些突变主要集中在ITS2区上，其中第468处的突变具有一定地域性，主要为德昌和西昌的菌株。利用MEGA6软件对20个供试菌株及GenBank中登陆的15个疫霉属菌株序列进行聚类分析，供试菌株与 GenBank 上登录的 GU111675.1、KF010303.1、AJ854295.1、KC768775.1、L41383聚在同一聚类组上，均为Phytophthora parasitica（或Phytophthora nicotianae），其它疫霉种聚在不同的聚类组上，遗传关系较远，这表明来自四川凉山不同地区的20株烟草黑胫病分离菌株均为寄生疫霉（Phytophthora parasitica）。