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四川凉山地区烟草黑胫病菌的ITS序列分析
四川凉山地区烟草黑胫病菌的ITS序列分析
作者:
严丹侃
刘东阳
卢军
周本国
张海珊
王勇
王芳
章东方
许大凤
高正良
原文服务方:
中国烟草科学
烟草黑胫病
ITS
寄生疫霉
烟草
摘要:
本研究利用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)通用引物,PCR 扩增四川省凉山州不同地区的20株烟草黑胫病菌的ITS序列,并对PCR产物进行了克隆测序。结果表明,20个供试菌株的ITS1-5.8S-ITS2总长均为803 bp;各菌株之间的ITS序列同源性达到99.3%以上;与GenBank报道的寄生疫霉台湾烟草分离株Phytophthora parasitica(GU111675.1)的同源性在99.6%~100%之间;但各菌株ITS序列的个别位点存在突变,这些突变主要集中在ITS2区上,其中第468处的突变具有一定地域性,主要为德昌和西昌的菌株。利用MEGA6软件对20个供试菌株及GenBank中登陆的15个疫霉属菌株序列进行聚类分析,供试菌株与 GenBank 上登录的 GU111675.1、KF010303.1、AJ854295.1、KC768775.1、L41383聚在同一聚类组上,均为Phytophthora parasitica(或Phytophthora nicotianae),其它疫霉种聚在不同的聚类组上,遗传关系较远,这表明来自四川凉山不同地区的20株烟草黑胫病分离菌株均为寄生疫霉(Phytophthora parasitica)。
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篇名
四川凉山地区烟草黑胫病菌的ITS序列分析
来源期刊
中国烟草科学
学科
关键词
烟草黑胫病
ITS
寄生疫霉
烟草
年,卷(期)
2015,(1)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
96-101
页数
6页
分类号
S572.09
字数
语种
中文
DOI
10.13496/j.issn.1007-5119.2015.01.018
五维指标
传播情况
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研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
中国烟草科学
主办单位:
中国农业科学院烟草研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1007-5119
CN:
37-1277/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1979-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
2120
总下载数(次)
0
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