中国沿海平疣桑椹石磺COI基因的遗传多样性与遗传分化

• 作者: 刘宸 周娜 姚理想 沈和定
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 平疣桑椹石磺 细胞色素c氧化酶亚基I(COI) 遗传多样性 遗传分化
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 729-739
• 页数: 11页
• 分类号: S94
• 字数: 6488字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2015.140533

摘要

基于 CO I 序列,对中国沿海5个平疣桑椹石磺(Platevindex mortoni)群体的遗传多样性及遗传分化进行了分析,84个样本中共检测出单倍型41个,多态性位点117个。总体来说,平疣桑椹石磺具有高的单倍型多样性(0.835±0.039)和核苷酸多样性(0.0572±0.0060)。分子方差分析(AMOVA)表明,65.98%的变异存在于种群间,34.02%的变异发生在种群内。群体间遗传分化固定指数(Fst)、基因流(Nem)及遗传距离分析表明,平疣桑椹石磺已产生了明显的群体间分化。厦门(XM)、湛江(ZJ)和广西(GX)群体间无明显分化,基因流较大(Nem>5),而海南(HN)、苍南(CN)群体分别与其他群体存在显著的分化。单倍型网络图及谱系树同样证实了群体遗传差异的存在。遗传距离模式(IBD)检测显示出,平疣桑椹石磺群体的遗传距离与地理距离之间不存在明显的线性关系。中性检验及历史动态检验推断, ZJ 和 GX 群体可能经历过历史上的瓶颈效应, XM 群体经历过历史上的种群扩张,扩张时间推测大约为0.12 Ma BP,可能伴随更新世冰期的气候变暖,海平面上升发生。本研究通过对平疣桑椹石磺 mtDNA 的 CO I基因进行分析,探讨其遗传多样性及遗传分化过程,旨在为该物种种质保护,资源合理开发及生物进化方面研究提供基础资料和理论依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈和定	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	71	477	13.0	17.0
2	姚理想	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	10	29	4.0	5.0
3	刘宸	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	6	34	4.0	5.0
4	周娜	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	3	10	2.0	3.0