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药用植物华重楼(黑药花科)叶绿体全基因组研究
药用植物华重楼(黑药花科)叶绿体全基因组研究
作者:
李晓娟
杨振艳
纪运恒
黄玉玲
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
叶绿体全基因组
华重楼
黑药花科
百合目
cemA假基因化
摘要:
为探究华重楼(Paris polyphylla var. chinensis)的叶绿体基因组特征,利用叶绿体系统发育基因组学方法,对华重楼与其它百合目植物的叶绿体全基因组进行了比较。结果表明,华重楼的叶绿体全基因组长158307 bp,由4个区组成,包括2个反向重复区(IRA和IRB,27473 bp)、1个小单拷贝区(SSC,18175 bp)和1个大单拷贝区(LSC,85187 bp)。其叶绿体基因组有115个基因,包括81个编码蛋白质基因、30个转运RNA基因和4个核糖体RNA基因。11种百合目植物的叶绿体全基因组的基因组成和基因顺序相似。华重楼的cemA基因是假基因,其起始密码子后有多聚核苷酸poly(A)及CA双核苷酸重复序列,编码序列中出现多个终止密码子,且与北重楼(Paris verticillata)的cemA编码序列中的终止密码子位置不同。因此,华重楼叶绿体基因组比较保守;cemA结构及假基因化现象可能具有重要的进化与系统发育信息,其编码序列中的终止密码子可以区分华重楼和北重楼。
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文献信息
篇名
药用植物华重楼(黑药花科)叶绿体全基因组研究
来源期刊
热带亚热带植物学报
学科
关键词
叶绿体全基因组
华重楼
黑药花科
百合目
cemA假基因化
年,卷(期)
2015,(6)
所属期刊栏目
植物系统学与生物地理学
研究方向
页码范围
601-613
页数
13页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11926/j.issn.1005-3395.2015.06.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李晓娟
中国科学院昆明植物研究所东亚植物多样性与生物地理学重点实验室
22
228
7.0
15.0
5
杨振艳
中国科学院昆明植物研究所东亚植物多样性与生物地理学重点实验室
3
6
1.0
2.0
6
纪运恒
中国科学院昆明植物研究所东亚植物多样性与生物地理学重点实验室
9
105
6.0
9.0
7
黄玉玲
中国科学院昆明植物研究所东亚植物多样性与生物地理学重点实验室
1
5
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引证文献(1)
二级引证文献(2)
研究主题发展历程
节点文献
叶绿体全基因组
华重楼
黑药花科
百合目
cemA假基因化
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
热带亚热带植物学报
主办单位:
中国科学院华南植物园
广东省植物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1005-3395
CN:
44-1374/Q
开本:
大16开
出版地:
广州天河区兴科路723号中国科学院华南植物园
邮发代号:
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
2032
总下载数(次)
6
总被引数(次)
31320
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热带亚热带植物学报2015年第5期
热带亚热带植物学报2015年第4期
热带亚热带植物学报2015年第3期
热带亚热带植物学报2015年第2期
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