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濒危红树植物莲叶桐叶绿体基因组及其系统进化
濒危红树植物莲叶桐叶绿体基因组及其系统进化
作者:
刘强
张世杰
张静文
张颖
李佳文
杨勇
原文服务方:
西北林学院学报
叶绿体基因组
濒危红树植物
莲叶桐
系统进化树
共线性分析
摘要:
对濒危红树植物莲叶桐的叶绿体基因组及与其近缘物种之间的叶绿体基因组进行比较进化分析.结果 表明,莲叶桐叶绿体基因组序列全长157762 bp,包括1个大的单拷贝区(LSC)86641 bp,1个小的单拷贝区(SSC)18603 bp和2个反转重复区(IRs)26260 bp.叶绿体基因组的GC含量为39.3%,含有133个基因,包括83个蛋白质编码基因、42个tRNA基因和8个rRNA基因.17个基因位于反转重复区,包括6个蛋白编码基因、7个tRNA和4个rRNA.登录号为:MG838431.通过最大似然法对16个双子叶植物(包含5个樟科植物、2个腊梅科植物、3个毛茛科植物、1个小檗科植物、1个报春花科植物、1个蔷薇科植物、1个桑科植物,1个安息香科植物以及莲叶桐)和1个外类群植物水稻的叶绿体基因组序列进行聚类分析,莲叶桐与樟科和腊梅科植物聚为一支.聚类结果将莲叶桐科划入樟目,更支持《中国高等植物图鉴》中分类方式.随后对莲叶桐及其近缘种叶绿体基因组进行了共线性分析,进一步验证了其叶绿体基因组之间具有高度保守性.研究结果为莲叶桐的系统进化提供了新的证据.
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篇名
濒危红树植物莲叶桐叶绿体基因组及其系统进化
来源期刊
西北林学院学报
学科
关键词
叶绿体基因组
濒危红树植物
莲叶桐
系统进化树
共线性分析
年,卷(期)
2020,(5)
所属期刊栏目
森林生物学
研究方向
页码范围
54-61
页数
8页
分类号
S796
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1001-7461.2020.05.09
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西北林学院学报
主办单位:
西北农林科技大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-7461
CN:
61-1202/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1984-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5683
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