孑遗濒危植物矮扁桃叶绿体全基因组特征分析及亲缘关系鉴定

• 作者: 孟庆瑶 张凯 杨斌 段义忠
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 矮扁桃 叶绿体全基因组 亲缘关系 高通量测序
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 686-695
• 页数: 10页
• 分类号: Q949.751.8
• 字数: 5021字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2020.05.007

摘要

对第三纪孑遗濒危植物矮扁桃(Amygdalus nana)叶绿体全基因组进行结构特征分析,并探究其与近缘物种之间的系统进化关系.利用Illumina HiSeq Xten测序技术获取叶绿体全基因组序列,对其进行组装、注释和特征分析.结果 表明:①矮扁桃叶绿体全基因组总长度为158 596 bp,其中LSC长度为86 771 bp,SSC长度为19 037bp,2个IRs均为26 394 bp,为环状四分体结构.共注释130个基因,包括85个PCGs、37个tRNA和8个rRNA.②对6种植物进行IR边界区扩张和收缩分析,发现在4个边界区的基因类型和基因分布情况存在一定差异,并且亲缘关系越紧密差异程度越小.③在矮扁桃叶绿体全基因组中共预测了71个SSRs位点.④系统发育分析结果显示,在扁桃亚属中,矮扁桃在亲缘关系上与蒙古扁桃更近,而与长柄扁桃和榆叶梅的亲缘关系稍远.本研究对矮扁桃叶绿体全基因组进行了深度剖析,并且涉及大量被子植物的叶绿体全基因组资料,为桃属植物之间的进化关系和植物鉴定提供参考依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	段义忠	榆林学院生命科学学院	30	108	6.0	9.0
2	杨斌	榆林学院生命科学学院	9	12	2.0	3.0
3	孟庆瑶	榆林学院生命科学学院	1	0	0.0	0.0
4	张凯	榆林学院生命科学学院	1	0	0.0	0.0