西北干旱区孑遗濒危植物四合木(Tetraena mongolica)叶绿体基因组特征研究及比较分析

• 作者: 杜忠毓 段义忠 王海涛
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 四合木 叶绿体基因组 高通量测序 系统发育关系
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 653-663
• 页数: 11页
• 分类号: Q948
• 字数: 5812字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2019.05.003

摘要

四合木(Tetraena mongolica)是我国特有的蒺藜科(Zygophyllaceae)强旱生小灌木,因其起源古老、抗逆性强,所以可作为生物多样性起源和环境演变研究的理想对象,具有重要的学术研究价值.本研究采用Illumina双末端测序技术对四合木叶绿体基因组进行建库测序和分析.选取蒺藜目及牻牛儿苗目共计30个物种叶绿体基因组,与四合木进行系统发育关系分析探讨.结果 表明:四合木叶绿体基因组长度为106 259 bp,其中反向重复区(IR区中)有7种基因,包括4种PCG基因,3种tRNA基因.叶绿体基因组共编码98种基因,包括65种蛋白编码基因、29种tRNA基因与4种rRNA基因.生物信息学表明,在四合木中共搜到92个SSR位点,其中包括74个单核苷酸重复基序,7个二核苷酸重复基序,1个三核苷酸重复基序,9个四核苷酸重复基序和1个五核苷酸基序.没有发现六核苷酸,其中单核苷酸重复在四合木的叶绿体基因组SSR中占比为80.1％.通过MEGA软件采用近邻结合法(neighbor-joining,NJ)对四合木等31个物种的叶绿体基因组进行聚类分析,发现四合木与蒺藜科三齿拉雷亚灌木为最近的姐妹种,其次为牻牛儿苗科智利白桦植物亲缘关系较近,与牻牛儿苗科天竺葵属和牻牛儿苗科高桂花属亲缘关系最远,说明四合木属于蒺藜科物种,这对于四合木的研究等具有一定的参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	段义忠	榆林学院陕西省陕北生态修复重点实验室	30	108	6.0	9.0
2	王海涛	榆林学院陕西省陕北生态修复重点实验室	4	3	1.0	1.0