厚壁毛竹六个节气笋芽发育的转录组分析

• 作者: 冉洪 张莹 田埂 胡陶 路慧萍 郭起荣
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 厚壁毛竹 节气 转录组 功能注释 代谢通路 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 林业科学
• 页码范围: 466-474
• 页数: 9页
• 分类号: S795.7|Q786
• 字数: 5678字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13836/j.jjau.2015073

摘要

厚壁毛竹（ Phyllostachys edulis‘Pachyloen’）是目前发现的毛竹多个变异类型中唯一一个有用材价值的优良新品种，但其分子遗传机制目前还未知。利用第二代高通量测序技术从霜降节气开始，对从霜降、大寒、冬至、雨水、春分、谷雨6个节气采集的厚壁毛竹笋芽分别进行转录组测序，共捕获30555个基因，基因平均覆盖率为79％。将不同节气的竹笋转录组进行两两比较，首次证实厚壁毛竹笋在不同节气基因表达有差异，其差异表达基因数从2288～12991，进一步将这些差异表达基因进行了GO功能注释和KEGG Pathway富集性分析，并初步报道了DNA复制、类胡萝卜素生物合成、淀粉和蔗糖代谢3个代谢通路的基因表达模式，在一定程度上解析了厚壁毛竹“竹壁特厚”等种质性状的分子调控模式及其机制。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭起荣	国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	71	623	14.0	21.0
2	胡陶	国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	16	137	8.0	11.0
3	冉洪	国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	9	31	3.0	5.0
4	张莹	国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	9	31	3.0	5.0
5	田埂	基因测序与合成平台清华大学生命科学学院	1	8	1.0	1.0
6	路慧萍	基因测序与合成平台清华大学生命科学学院	1	8	1.0	1.0