基于microRNA调控网络预测卵巢癌多药耐药相关基因

• 作者: 李力 胡艳玲 陈昌贤
• 来源期刊: 中国肿瘤生物治疗杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 卵巢癌 多药耐药 基因 microRNA调控网络 预测 神经素1基因
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 204-208
• 分类号: R737.31|R730.59|Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.3872/j.issn.1007-385X.2015.02.011

摘要

目的:基于microRNA (miRNA)调控网络预测卵巢癌多药耐药相关基因.方法:综合运用文本挖掘、网络构建和预测等生物信息学分析方法,挖掘卵巢癌化疗耐药相关miRNA和miRNA-靶基因数据,并构建miRNA调控网络,利用已知miRNA对卵巢癌多药耐药相关基因进行预测.结果:文本挖掘出11个与卵巢癌化疗耐药相关的miRNA,包括miR-130a、miR-214、let-7i、miR-125b、miR-376c、miR-199a、miR-93、miR-141、miR-130b、miR-193b*和miR-200c.在miRNA靶基因预测数据软件TargetScan中挖掘出47 077个miRNA-靶基因数据,而PicTar挖掘出1 675个miRNA-靶基因数据.在miRNA调控网络中,神经素1基因(neuropilins,NRP1)是最重要的Hub-基因.结论:利用已知miRNA构建miRNA调控网络进而预测卵巢癌多药耐药相关基因是一种行之有效的方法.NRP1极有可能在卵巢癌化疗耐药形成中扮演着重要的角色,是卵巢癌潜在的药物治疗靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李力	广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科	377	1810	20.0	26.0
2	胡艳玲	广西医科大学医学科学实验中心生物信息学教研室	24	44	3.0	5.0
3	陈昌贤	广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科	18	84	4.0	8.0