大豆胞囊线虫侵染诱导五寨黑豆早期的转录组分析

• 作者: 李海燕 段玉玺 王芳 陈立杰
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 侵染 大豆胞囊线虫 转录组 Illumina高通量测序
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 土肥植保
• 页码范围: 194-200
• 页数: 7页
• 分类号: S435.651
• 字数: 4945字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2015.02.011

摘要

利用Illumina HiSeqTM2000对大豆胞囊线虫侵染前后的抗病大豆品种五寨黑豆的转录组进行检测.将测序的两个文库进行拼接,得到长度大于200bp的reads共20 980 831条,总长度约为4.23Gb,筛选到1 045个差异表达基因.Gene ontology功能显著性富集发现差异表达基因在生物过程注释基因最多,共有1 007个差异表达基因.在COG数据库中对基因产物进行直系同源分类,结果表明众多基因参与到碳水化合物及氨基酸的运输和代谢、次生代谢物质合成及信号传导机制过程,并受胞囊线虫侵染的诱导表达.KEGG代谢通路分析显示差异表达基因在苯丙烷类及氧化磷酸化代谢通路显著富集,说明这两个代谢通路在五寨黑豆抗胞囊线虫病中起重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	段玉玺	沈阳农业大学植物保护学院北方线虫研究所	237	2380	22.0	37.0
2	陈立杰	沈阳农业大学植物保护学院北方线虫研究所	186	1503	19.0	26.0
3	王芳	齐齐哈尔大学生命科学学院	27	60	4.0	6.0
4	李海燕	沈阳农业大学植物保护学院北方线虫研究所	42	230	8.0	14.0