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胞囊线虫侵染后小粒黑豆抑制消减杂交cDNA文库的构建及EST分析
胞囊线虫侵染后小粒黑豆抑制消减杂交cDNA文库的构建及EST分析
作者:
朱晓峰
段玉玺
王东
王媛媛
王芳
陈立杰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大豆胞囊线虫
大豆
抑制消减杂交
表达序列标签
摘要:
[目的]研究胞囊线虫侵染后大豆根部早期基因表达情况,从分子水平探索大豆的抗病机制.[方法]以抗大豆胞囊线虫(Heterodera glycines)3号生理小种的小粒黑豆(Glycine max)为材料,利用抑制消减杂交( suppress ion subtractive hybridization,SSH)技术,构建大豆胞囊线虫诱导大豆根部早期表达的SSH-cDNA 文库,并结合反向Northern斑点杂交筛选阳性克隆.[结果]获得280个表达序列标签(EST),经CAP3软件聚类拼接,得到166个unique EST,在GenBank进行Blastn与Blastx同源比对,有119条EST与已知蛋白或基因具有不同程度的同源性,占全部EST的83%,已知基因功能的EST涉及信号识别和传导、能量与物质新陈代谢、膜及转运、木质素和类黄酮的生物合成、抗病防御、细胞保护和转录调控.[结论]本研究在大豆胞囊线虫侵染早期发现了表达频率较高的基因如过氧化氢酶、泛肽素、几丁质酶、脂肪氧合酶、水通道蛋白、成熟调控蛋白、金属硫蛋白、脂膜嵌入蛋白、细胞色素P450和3-磷酸甘油醛脱氢酶等,并推测这些基因在大豆与胞囊线虫的非亲和互作过程中起重要作用.
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文献信息
篇名
胞囊线虫侵染后小粒黑豆抑制消减杂交cDNA文库的构建及EST分析
来源期刊
中国农业科学
学科
农学
关键词
大豆胞囊线虫
大豆
抑制消减杂交
表达序列标签
年,卷(期)
2012,(6)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
1106-1115
页数
分类号
S435.29
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2012.06.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
段玉玺
沈阳农业大学植物保护学院
237
2380
22.0
37.0
2
陈立杰
沈阳农业大学植物保护学院
186
1503
19.0
26.0
3
王媛媛
沈阳农业大学植物保护学院
92
558
12.0
17.0
4
王芳
沈阳农业大学植物保护学院
208
390
9.0
14.0
6
朱晓峰
沈阳农业大学植物保护学院
60
405
11.0
16.0
9
王东
沈阳农业大学植物保护学院
3
16
2.0
3.0
传播情况
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引文网络
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参考文献(0)
二级参考文献(1)
1991(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1993(3)
参考文献(0)
二级参考文献(3)
1994(3)
参考文献(1)
二级参考文献(2)
1995(3)
参考文献(1)
二级参考文献(2)
1996(10)
参考文献(4)
二级参考文献(6)
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2019(1)
引证文献(0)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
大豆胞囊线虫
大豆
抑制消减杂交
表达序列标签
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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