毛皮动物肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛A基因克隆测序与生物信息分析

• 作者: 于翠莲 刘丽萍 姜晓东 朱瑞良 王传文 王振 迟珊珊 邵明旭 钟世勋
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 肺炎克雷伯菌 MrkA基因 二级结构 B细胞抗原表位预测
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 人兽共患病
• 页码范围: 74-80
• 分类号: S852.61
• 语种: 中文

摘要

根据GenBank中肺炎克雷伯菌Ⅲ型菌毛结构基因A(MrkA)JF759921的序列设计1对引物,对8株毛皮动物肺炎克雷伯菌进行克隆测序,并应用生物信息学相关软件和方法,预测MrkA蛋白二级结构和B细胞抗原表位.PCR扩增出了609 bp的目的基因片段,生物信息分析结果显示其开放阅读框架为609 bp,编码202个氨基酸;二级结构以无规卷曲为主,有少量的a-螺旋和β-片层,少见β-转角,推测MrkA蛋白有8个B细胞优势抗原表位区域.结果表明,MrkA基因较稳定,其在进化过程中并未发生明显变异,为进一步分析肺炎克雷伯菌免疫机理、制备单克隆抗体和设计表位疫苗等奠定理论基础.