北方地区白菜型冬油菜与春油菜的SSR和InDel遗传多样性分析

• 作者: 刘林波 刘自刚 孙万仓 张树娟 方彦 曾秀存 杨刚 杨建胜 王丽萍
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 白菜型油菜 遗传多样性 SSR InDel
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 21-26
• 页数: 6页
• 分类号: S565.403
• 字数: 3970字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2015.01.004

摘要

为了合理评价北方地区白菜型油菜种质资源,为抗寒育种及组合配制提供依据,从252对标记中筛选出9对SSR和36对InDel标记对感温性、抗寒性、品质等性状差异明显的19份白菜型油菜品种的遗传多样性和亲缘关系进行了分析.结果表明,共检测到95个等位变异,平均每个标记2.15个;有效等位基因变幅为1.05 ～3.27个,平均为1.70个.Shannon指数的变幅范围在0.121 7～1.269 5间,平均值为0.580 3;多态性信息量PIC变幅范围为0.049 9 ～0.637 7,平均值为0.308 1.通过NTSYS计算遗传相似系数GS并按加权配对法(UPGMA)聚类,结果表明19份材料的GS变异在0.52～0.86之间.在GS为0.605水平上可将19份材料按两室与多室性划分为Ⅰ-1和Ⅰ-2两大类群,Ⅰ-1类群在GS为0.655水平上可按冬春性分为Ⅱ-1、Ⅱ-2两个亚类群.在GS为0.71水平上,可将冬性材料划分为4个小群.聚类结果表明北方地区白菜型油菜的遗传多样性丰富,冬、春性品种间及春性品种间亲缘关系较远,存在较大遗传差异.