鸡IGF2基因多态性及蛋白相关分析

• 作者: 张小卿 李太山 綦世金 郭发荣 陈彬
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: IGF2基因 SNPs 系统发育 生物信息学 鸡
• 年，卷（期）: 2015,（17）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 16-22
• 页数: 7页
• 分类号: S831.2
• 字数: 3268字
• 语种: 中文

摘要

为全面了解IGF2基因的多态性、系统发育关系以及IGF2蛋白功能位点,本实验利用DNA池结合PCR产物直接测序法和生物信息学对9个鸡品种11种样本的IGF2基因进行系统研究.结果表明:共检测到IGF2基因的9个SNPs,其中3个错义突变导致蛋白性质发生改变;NJ树整体分为三大支,其中绿壳蛋鸡与其他品种遗传差异最大;突变后RNA二级结构、最小自由能和稳定性随之变化;IGF2蛋白存在典型跨膜螺旋区和信号肽,包含2个高度保守的结构功能域ⅡGF和IGF2-C;同源模建得到了理想可靠的IGF2蛋白三维结构模型.显示,IGF2基因遗传多样性相对较高,突变位点在各群体中分布不平衡,可为进一步研究IGF2蛋白功能奠定理论基础.