hsa-miR-10 b在3株宫颈癌细胞系中的表达及靶基因预测

• 作者: 于洋 俞天虹 喻妙梅 罗光华
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学 microRNA hsa-miR-10b 靶基因预测
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1237-1242
• 页数: 6页
• 分类号: R73-3
• 字数: 2621字
• 语种: 中文

摘要

目的：分析3株宫颈癌细胞系中hsa-miR-10b表达水平，并预测hsa-miR-10b的靶基因。方法用PCR技术检测3株宫颈癌细胞系中hsa-miR-10b表达水平；PubMed检索hsa-miR-10b相关文献；miRbase和NCBI分析其序列保守性及所在基因组特征；TargetScan、PicTar及miRanda数据库预测其靶基因，并结合已证实的靶基因对其进行功能和信号通路富集分析。结果与C-33A相比，HeLa和CaSki中hsa-miR-10b表达水平显著下调（P＜0.01）；hsa-miR-10b与多种肿瘤的发生发展有关；hsa-miR-10b定位于人染色体2q31.1，在各物种之间具有高度保守性；其靶基因主要参与转录、基因表达调控和细胞增殖等生物学过程（ P＜0.05），涉及肿瘤、细胞周期和ARF等信号通路（ P＜0.05）。结论 hsa-miR-10b功能广泛，与宫颈癌的发生发展密切相关，靶基因的预测为后续研究提供依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗光华	苏州大学附属第三医院综合实验室	86	240	7.0	11.0
2	于洋	苏州大学附属第三医院综合实验室	21	54	3.0	6.0
3	俞天虹	苏州大学附属第三医院综合实验室	5	56	3.0	5.0
4	喻妙梅	苏州大学附属第三医院综合实验室	4	7	2.0	2.0