广州地区人巨细胞病毒临床低传代株UL138基因的序列特征及多态性分析

• 作者: 伍苑宾 密英鸽 王波 胡兢晶 苏海浩 蔡丽君 郭梦杰
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 人巨细胞病毒 临床病毒株 UL138 基因序列 多态性
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 分子流行病学
• 页码范围: 407-413
• 页数: 7页
• 字数: 4508字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2015.06.002

摘要

目的：研究广州地区新生儿感染人巨细胞病毒（ HCMV）临床低传代分离株UL138基因序列特征与多态性。方法从10例被证实为临床HCMV感染的新生儿尿液标本中分离HCMV低传代临床病毒株，进行多重PCR鉴定。对临床分离株进行HCMV UL138基因扩增、克隆、鉴定、测序及呈报GenBank；同时在GenBank搜索HCMV UL138同源序列，行序列分析，应用生物信息学在线软件分析UL138基因翻译后修饰位点、二级结构及等电点。结果成功分离3株HCMV临床病毒株，分别命名为 HCMV D3、D2和 D52。克隆测序后呈报 GenBank 并被收录。收录序列号分别为：DQ180375、DQ180387和DQ180359。分析结果显示在HCMV临床低传代D3、D2和D52病毒株UL138基因全序列841个碱基中，存在16个位点变异，可能编码的蛋白质氨基酸残基总数为169个，其基因序列高度保守，核苷酸变异均为碱基替换，无插入或缺失，碱基替换导致了7处氨基酸的改变。HCMV UL138蛋白翻译后修饰位点在除Toledo株外的所有分离株中均高度保守；所有分离株UL138蛋白的预测等电点均为6．51。结论广州地区感染婴儿的HCMV UL138基因及其编码的氨基酸序列极为保守，但仍具有一定的多态性，这在HCMV临床感染与致病机制研究中具有重要意义。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王波	广东省妇幼保健院儿科	47	196	9.0	11.0
2	蔡丽君	广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科	5	7	2.0	2.0
3	胡兢晶	广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科	5	9	2.0	3.0
4	苏海浩	广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科	5	9	2.0	3.0
5	伍苑宾	广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科	3	6	2.0	2.0
6	密英鸽	广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科	4	9	2.0	3.0
7	郭梦杰	广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科	2	4	1.0	2.0