西瓜抗根结线虫相关基因的克隆与表达分析

• 作者: 刘君璞 孙德玺 安国林 徐小军 朱迎春 李卫华 薛莹莹 邓云
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 野生西瓜 根结线虫 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 1107-1113
• 页数: 7页
• 分类号: S651
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20150199

摘要

[目的]筛选西瓜(Citrullus lanatus)抗根结线虫相关基因,克隆其全长CDS序列,检测根结线虫接种后其在抗病材料和感病材料中的表达特征,分析其与西瓜根结线虫抗性的关系.[方法]以抗根结线虫的野生西瓜‘09005’和易感根结线虫的栽培西瓜‘ZDPI0006’为试材,用已知的植物抗线虫基因在葫芦科基因组数据库中比对,从结果中筛选到西瓜的相关基因Cla006580,与甜菜抗孢囊线虫基因HsPro-1同源性达到65％,命名为ClaHs1-1.克隆ClaHs11基因的CDS区序列并进行生物信息预测分析,在根结线虫接种处理和CK处理72 h内利用qRT-PCR技术检测不同抗性的西瓜根系中ClaHs1-1的表达特征.[结果]从野生抗病西瓜‘09005’和栽培易感西瓜‘ZDPI0006’中均克隆得到ClaHs 1pr01基因,CDS区序列全长1 434 bp,编码478个氨基酸,含有Hs1 pro-1 _N和Hs1pro-1_C两个蛋白保守结构域,抗、感材料之间存在4个SNP位点.RT-PCR分析显示‘09005’在接种根结线虫后ClaHsJ”1表达趋势呈先抑后扬,而在CK中呈先扬后抑,二者相反;‘ZDPI0006’在接种根结线虫后ClaHsJ一1表达趋势呈先上扬后抑制再上扬,与CK中表达趋势一致.[结论]西瓜ClaHs1一1基因在抗病材料中表达特征与根结线虫接种密切相关,而在感病材料中与根结线虫接种无明显相关性,是西瓜抗根结线虫可能的候选基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李卫华	中国农业科学院郑州果树研究所	30	127	7.0	9.0
2	刘君璞	中国农业科学院郑州果树研究所	46	233	7.0	13.0
3	邓云	中国农业科学院郑州果树研究所	38	196	8.0	12.0
4	安国林	中国农业科学院郑州果树研究所	26	65	5.0	6.0
5	徐小军	中国农业科学院郑州果树研究所	21	47	3.0	5.0
6	薛莹莹	中国农业科学院郑州果树研究所	4	1	1.0	1.0
7	孙德玺	中国农业科学院郑州果树研究所	31	112	6.0	8.0
8	朱迎春	中国农业科学院郑州果树研究所	24	89	6.0	8.0