布氏菌分离株16SrDNA基因遗传进化分析

• 作者: 刘志国 刘日宏 夏咸柱 崔步云 王妙
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 布氏菌 16S rDNA 遗传进化 分析
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 700-703
• 页数: 4页
• 分类号: R378
• 字数: 2602字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2015.08.003

摘要

目的 检测内蒙古布氏菌临床分离株的16SrDNA基因序列,构建16SrDNA遗传进化树,确定该菌株的分类地位.方法 用BCSP31-PCR对临床分离株检测,再进行16SrDNA双向测序;从GeneBank下载标准参考菌株和与布氏菌有共同抗原细菌的16SrDNA基因序列;用Mega6.0进行序列比对并构建遗传进化树.结果 BCSP31-PCR结果显示均有223 bp扩增条带,16SrDNA测序得到单一基因序列;比对后发现有4处特异片段,经Blast比对,位于844-1224包括380 bp的片段为布氏菌独有;进化树显示布氏菌临床分离株与标准菌株聚在1个末端分支上,遗传距离接近0,无法精细区分相互关系;与人苍白杆菌聚集在1个亚分支上,遗传距离0.019;与其它试验菌株如霍乱弧菌、小肠结肠炎耶尔菌遗传进化距离较远,遗传距离＞0.02.结论 从遗传进化角度对布氏菌分离株与标准菌株的亲缘关系进行分析,布氏菌所有种型遗传距离接近,提示布氏菌16SrDNA为高度保守序列,不宜做遗传进化分析的靶基因;布氏菌与人苍白杆菌有较近的亲缘关系;布氏菌属16SrDNA特有的380 bp的基因片段可作为布氏菌快速鉴定的靶序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔步云	中国疾病预防中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室感染性疾病诊治协同创新中心	73	1226	15.0	32.0
2	夏咸柱	内蒙古农业大学兽医学院	61	402	11.0	15.0
4	刘志国	内蒙古农业大学兽医学院	10	35	4.0	5.0
6	刘日宏		17	67	5.0	7.0
9	王妙		8	28	4.0	5.0