一株H1N1猪流感病毒的进化分析与分子特征

• 作者: 乔传玲 尹航 徐汇洋 杨大为 杨焕良 许榜丰 陈化兰 陈艳 隋金钰
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 猪流感病毒 类禽型 H1N1 进化分析 分子特征
• 年，卷（期）: 2015,（15）
• 所属期刊栏目: 专题:流感病毒对人类和畜牧业健康的影响
• 页码范围: 3071-3078
• 页数: 8页
• 语种: 中文

摘要

【目的】了解猪流感病毒的分子流行病学，为动物流感的防控提供科学依据。【方法】将猪的鼻拭子接种鸡胚进行病毒分离，对血凝试验阳性的样品在SPF鸡胚上进一步纯化、增殖，采用RT-PCR对分离毒株的全基因组进行扩增，使用Applied Biosystems 3500xL Genetic Analyzer进行序列测定，利用DNASTAR软件对测序基因片段进行整个阅读框的核苷酸序列同源性比对分析，并用 MEGA 6.0绘制遗传进化树及分析氨基酸位点。【结果】分离毒株 A/swine/Zhejiang/245/2013（SW/ZJ/245/13）为 H1N1亚型病毒，核苷酸的分析结果发现该分离毒株的8个基因片段均与中国近期分离的 H1N1亚型流感病毒高度同源，属于类禽型猪H1N1的进化分支，没有出现不同基因型流感病毒片段之间的重组。分离株 HA 蛋白的裂解位点序列为IPSIQSR↓G，具有典型低致病力流感病毒的分子特征；HA 蛋白5个抗原位点区域与其同源性最高毒株完全一致，表明抗原性未发生改变；HA蛋白受体结合位点中190 D以及225 E，表明SW/ZJ/245/13与SA-α-2，6-Gal受体有较强的结合能力，而SA-α-2，6-Gal受体普遍存在于哺乳动物宿主（猪和人）上呼吸道中；HA共有6个潜在糖基化位点，其中4个（N27、N40、N212和N291）位于HAl区，2个（N498和N557）位于HA2区；NA有7个潜在糖基化位点，其中4个（N50、N58、N63和N68）在链接区，其他3个（N88、N146和N235）在结构域；PB2蛋白具有271T、627E和701N的氨基酸组合；M2蛋白发生抗药位点S31N的突变。【结论】类禽型H1N1猪流感病毒的持续存在和不断变异，提示应加强猪流感的监测，为动物流感的防控提供重要的科学依据。