肉牛 CAST 基因5′UTR 和3′UTR 多态性分析

• 作者: 万发春 刘振山 刘晓牧 刘桂芬 宋恩亮 谭秀文
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鲁西黄牛 渤海黑牛 CAST基因 5′UTR 3′UTR 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医? 蚕桑水产
• 页码范围: 108-112
• 页数: 5页
• 分类号: S823.2
• 字数: 3857字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2015.03.029

摘要

钙蛋白酶抑制蛋白（ Calpastatin，CAST）专一抑制钙蛋白酶（ Calpain，CAPN）活性，参与调节牛肉的嫩化及肌内蛋白的水解，其编码基因是肉质性状的主要候选基因。本研究根据牛CAST基因5′UTR区（ Gen－Bank No ．AY834771）和3′UTR区（ GenBank No ．DQ991097）序列设计两对引物，用PCR－SSCP方法对鲁西黄牛和渤海黑牛共305个样本进行了单核苷酸多态性分析。结果显示， CAST 基因5′UTR和3′UTR区存在PCR－SSCP多态，在5′UTR区存在6437（C／T）、6477（G／A）和6614（G／T）3个SNP位点，表现为AA、AB、BB、BC和AD 5种基因型；在3′UTR区存在359（T／C）和366（A／G）2个SNP位点，表现为EE、EF、FF和EG 4种基因型。经检验表明，鲁西黄牛和渤海黑牛均处于非Hardy－Weinberg平衡状态；群体遗传多态性分析表明这两种牛的多态信息含量均为中度多态。