苏淮猪BMP4基因3'-UTR区克隆和多态性分析

• 作者: 刘红林 吴艳 张建生 李齐发 王钧顺 邢军 郭苹 马百全 魏天雨
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苏淮猪 BMP4基因 3'-UTR SNP 多态性
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 页码范围: 819-824
• 分类号: S828.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201602002

摘要

[目的]本试验旨在研究梅山猪和苏淮猪BMP4(bone morphogenetic protein 4)基因3'-UTR区序列特征,分析苏淮猪BMP4基因3'-UTR区SNP位点并了解苏淮猪和高繁殖力猪种梅山猪BMP4基因3'-UTR SNP位点多态性.[方法]采用克隆测序技术获得苏淮猪BMP4基因3'-UTR区序列;利用生物信息学方法分析其序列特征;利用池DNA测序技术筛选SNPs,采用AS-PCR技术分析苏淮猪和梅山猪SNPs位点多态性.[结果]苏淮猪BMP4基因3'-UTR区序列长度为267 bp,含有一个(AC)9微卫星位点和PolyA结构;在苏淮猪BMP4基因3'-UTR区20 nt处发现一个SNP,AS-PCR检测到3种基因型(GG、GC和CC);在苏淮猪中,GG型和G等位基因为优势基因型和优势等位基因,频率分别为0.815和0.887,而在高繁殖力猪种梅山猪中CC型和C等位基因为优势基因型和优势等位基因,频率分别为为0.667和0.770.[结论]获得了BMP4基因3'-UTR区序列,鉴定了一个新的SNP位点,发现BMP4基因3'-UTR区20G＞C位点多态性可能与猪繁殖性能有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘红林	南京农业大学动物科技学院	116	1257	21.0	30.0
2	马百全	南京农业大学动物科技学院	2	2	1.0	1.0
3	魏天雨	南京农业大学动物科技学院	1	1	1.0	1.0