16S rRNA高通量测序研究有龋者唾液微生物群落结构及多样性

• 作者: 何祥一 周建业 曾飒 李志强 游祥磊 王少果 车春晓
• 来源期刊: 口腔医学研究
• 学科: 医学
• 关键词: 龋病 微生物群落结构 16S rRNA高通量测序 唾液
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 临床研究论著
• 页码范围: 461-465
• 页数: 5页
• 分类号: R780.1
• 语种: 中文

摘要

目的:通过16S rRNA高通量测序研究有龋和无龋者唾液的微生物群落结构及其差异.方法:在甘肃省康乐县景古镇居民口腔检查中随机选取14位汉族居民,其中,7例有龋(caries-active,CA组,DMFT≥4)、7例无龋(caries-free,CF组).采取唾液样本,提DNA,PCR扩增,利用Illumina Miseq测序平台对16S rRNA V4区进行双端测序;利用Mothur、MEGAN4、Cluster 3.0和Java Treeview等软件进行细菌群落结构及多样性的差异分析.结果:共得到118151条优质序列,发现5738个OTUs,2795个物种,归属27个门,218个属.CA组和CF组唾液微生物群落结构有差异,其中,门水平上,Firmicutes和SR1在CA组显著低于CF组(P＜0.05).属水平上,Rothia、Alistipes和Catonella在CA组显著低于CF组(P＜0.05),Scardovia在CA组显著高于CF组(P＜0.05);CA组和CF组OTUs分别为(550.2±26.48),(597.4±66.07),CA组和CF组Simpson多样性指数分别为(0.73±0.03),(0.49±0.01),均无统计学差异.结论:人类口腔唾液有复杂的微生物群落结构;在门水平和属水平上,有龋者的微生物种类较无龋者稍有减少;Firmicutes和SR1菌门,Rothia、Alistipes和Catonella菌属的存在与龋病呈负相关;相反地,Scardovia等菌属的存在与龋病呈正相关.