四川部分地区猪流行性腹泻的分子流行病学调查

• 作者: 张丹 张小会 文心田 曹三杰 朱书全 梁恩涛 段素芬 阳酉萍 黄小波
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻 M基因 RT-PCR S基因,分子流行病学 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 704-710
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文

摘要

本研究对四川猪流行性腹泻病毒(PEDV)开展了分子流行病学调查.参照毒株CV777的M基因序列,设计1对特异性引物(预期扩增大小为392 bp),建立了快速检测PEDV的RT-PCR技术,对四川9个地区规模化猪场的75份仔猪腹泻病料进行检测与分析.再根据S基因的变异区域设计1对引物(扩增大小为947 bp),选择扩增了四川9个地区的代表样品的S基因序列,并进行了进化与变异分析.结果显示,建立了检测PEDV的M基因的RT-PCR技术,并确定了最佳反应条件和反应体系,用该方法检测了四川75份腹泻病料,检出64份PEDV阳性,PEDV阳性检出率为86.67％,结果显示PEDV在四川地区发病季节除冬春季外,近年夏季也呈高发趋势.四川9株PEDV的S基因的核苷酸同源性为95.9％～100％,氨基酸同源性为95.1％～100％,四川毒株与14个国内外参考毒株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为84.6％～99.5％和84.2％～99.5％;四川流行毒株的S基因(S蛋白)存在碱基(氨基酸)缺失和插入现象.结果表明,本研究从分子流行病学角度证实了四川部分地区PEDV的流行与变异情况,为指导该地区PEDV科学防控提供了依据.