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禾谷镰刀菌 Homeobox 转录因子 FgHtf1敲除突变体基因差异表达分析
禾谷镰刀菌 Homeobox 转录因子 FgHtf1敲除突变体基因差异表达分析
作者:
乔向威
余文英
张红红
王宗华
郑文辉
陈阿海
骆琼
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
禾谷镰刀菌
产孢
同源异型盒基因
RNA-Seq
基因差异表达
摘要:
禾谷镰刀菌是引起小麦赤霉病的主要病原真菌。分生孢子在侵染过程中起关键作用。先前研究表明同源异型盒(Ho-meobox)转录因子 FgHtf1特异调控分生孢子的产生。为明确其调控产孢的分子机制,本研究采用高通量 RNA 测序技术(RNA-Seq),对ΔFghtf1突变体菌株和野生型 PH-1菌株进行测序,结果显示其中591个基因转录上调,549个基因下调。对这些基因进行功能预测并聚类分析发现:上下调基因中分别有约30%和22%参与新陈代谢和能量转运。运用荧光定量 PCR,检测10个基因的表达,验证了 RNA-Seq 的结果是可靠的。运用同源重组方法敲除明显下调的基因 FGSG 10565和 FGSG 07629,表型分析结果显示,相比野生型,ΔFGSG 10565和ΔFGSG 07629的生长速率和产孢量均不变,说明两个基因的表达受FgHtf1调控,但功能上不直接参与分生孢子的形成。
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同源异型盒基因
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内容分析
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文献信息
篇名
禾谷镰刀菌 Homeobox 转录因子 FgHtf1敲除突变体基因差异表达分析
来源期刊
中国科技论文
学科
农学
关键词
禾谷镰刀菌
产孢
同源异型盒基因
RNA-Seq
基因差异表达
年,卷(期)
2015,(12)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1392-1397
页数
6页
分类号
S432.1
字数
3632字
语种
中文
DOI
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研究主题发展历程
节点文献
禾谷镰刀菌
产孢
同源异型盒基因
RNA-Seq
基因差异表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国科技论文
主办单位:
教育部科技发展中心
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-2783
CN:
10-1033/N
开本:
大16开
出版地:
北京市海淀区中关村大街35号教育部科技发展中心
邮发代号:
创刊时间:
2006
语种:
chi
出版文献量(篇)
4942
总下载数(次)
10
总被引数(次)
14783
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