四种不同方法提取人粪便细菌基因组脱氧核糖核酸的比较

• 作者: 刘琦琦 包艳 王占黎 王宁 高磊
• 来源期刊: 包头医学院学报
• 关键词: 粪便 细菌基因组DNA 聚合酶链式反应
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 页码范围: 148-150,151
• 页数: 4页
• 字数: 4370字
• 语种: 中文

摘要

目的：比较四种方法提取人粪便细菌基因组DNA 的效果。方法：收集30例健康受试者的粪便，采用改进的氯仿抽提法、改进的十六烷基三甲基溴化铵（cetyl trimethyl ammonium bromide ，CTAB）法、改进的液氮冻融法及粪便基因组脱氧核糖核酸（deoxyri‐bonucleic acid ，DNA）试剂盒法提取 DNA ，通过微量紫外分光光度计对总产量和纯度进行分析。并选择 V3区配对的引物，PCR 扩增细菌16S rDNA基因序列，比较不同方法提取人粪便基因组DNA 效率的差异。结果：采用改进的氯仿抽提法、改进的CTAB 法、改进的液氮冻融法提取和粪便基因组DNA 试剂盒法提取的DNA 浓度分别为（91．05±58．35）ng／μL、（7．06±3．25）ng／μL、（784．00±69．13）ng／μL、（209．98±39．30）ng／μL ，四组两两比较，差异具有统计学意义（ P ＜0．01）。结论：粪便基因组DNA试剂盒法在提取的基因组 DNA纯度、PCR产物扩增电泳，耗时等方面均优于其他三种方法。但改进的氯仿抽提法、改进的 CTAB 法、改进的液氮冻融法的优点是满足后期使用条件的前提下，提取费用相对较低。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘琦琦	包头医学院公共卫生学院	8	13	3.0	3.0
2	包艳	包头医学院公共卫生学院	23	38	3.0	5.0
3	王占黎	包头医学院公共卫生学院	29	46	4.0	5.0
4	王宁	包头医学院公共卫生学院	6	6	2.0	2.0
5	高磊	包头医学院公共卫生学院	18	120	5.0	10.0