目的:了解哈尔滨市2012年手足口病病原特点。方法采用Real time RT-PCR 对2012年采集的粪便、咽拭子、肛拭子等标本检测肠道病毒、CoxA16、EV71。结果共检测手足口标本1046份,肠道病毒阳性676份(64.6%),EV71阳性83份(7.9%),CoxA16阳性489份(46.7%),其他肠道病毒104份(15.3%);阳性标本中,男性阳性382份(56.5%),女性阳性294份(43.5%);全年6~7月份为高峰,肠道病毒感染主要集中于5岁以下儿童,占阳性标本的89.9%。结论5岁以下儿童是手足口病感染的主要人群,2012年哈尔滨市手足口主要流行株为CoxA16,而EV71和其他HEV也同时存在。