3种芸薹属植物ROH1基因的克隆及分析

• 作者: 周燕 廉小平 张贺翠 李帮秀 柳菁
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: ROH1基因 基因克隆 DUF793蛋白超家族
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 18-21,46
• 页数: 5页
• 分类号: S188
• 字数: 3766字
• 语种: 中文

摘要

[目的]通过PCR和RT-PCR技术从甘蓝、白菜和萝卜中扩增ROH1基因序列,分析该基因的基本特性.[方法]采用生物信息学的相关方法进行分析.[结果]甘蓝、白菜、萝卜 ROH1基因没有内含子,甘蓝ROH1基因编码398个氨基酸,白菜和萝卜ROH1基因均编码400个氨基酸,3种植物的ROH1蛋白序列与拟南芥已经公布的ROH1(At1 g63930)蛋白氨基酸缺少一段连续的氨基酸序列;ROH1属于DUF793蛋白超家族,它没有跨膜结构域和信号肽,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成.同源比对及功能联想分析发现植物中ROH1非常保守,系统发育分析表明甘蓝、白菜和萝卜的关系最近;结构功能分析发现ROH1可能与BYPASS蛋白和AT4G11300蛋白的功能相似.[结论]为研究DUF793蛋白超家族功能提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周燕	西南大学农学与生物科技学院	22	25	3.0	4.0
2	李帮秀	西南大学农学与生物科技学院	17	99	7.0	9.0
3	张贺翠	西南大学农学与生物科技学院	18	41	3.0	5.0
4	廉小平	西南大学农学与生物科技学院	8	21	2.0	4.0
5	柳菁	西南大学农学与生物科技学院	1	2	1.0	1.0