紫斑牡丹表型性状与SSR分子标记的关联分析

• 作者: 吴静 庞利铮 成仿云 蔡长福 钟原
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 紫斑牡丹 SSR标记 遗传多样性 群体结构 关联分析
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 园艺学 Horticulture Sciences
• 页码范围: 80-87
• 页数: 8页
• 分类号: S685.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.13332/j.1000-1522.20150377

摘要

利用筛选出的11对多态性简单重复序列( SSR)标记对99份紫斑牡丹材料进行多态性扫描,在分析其遗传多样性和群体结构的基础上,采用TASSEL2.1软件的一般线性模型( GLM)进行标记与32个观赏性状的关联分析。结果表明：11个多态性SSR标记共检测到94个等位变异,平均每个位点检测到等位变异8.5个；引物的多态性信息含量(PIC)变幅为0.146~0.850,平均值为0.593；遗传多样性变幅为0.152~0.862,平均为0.630。群体结构分析将供试材料划分为3个亚群；通过关联分析,发现5个标记位点与6个性状显著关联(P<0.01),各标记位点对表型变异的解释率为30.4%~55.8%,其中FJ024285和FJ024294标记与株高相关联,FE528073与顶小叶长、柱头颜色和房衣颜色相关联,FJ024287与柄叶比相关联,EU678295与色斑大小相关联。研究表明：所选紫斑牡丹种质资源群体的群体结构简单、遗传变异较为丰富,适用于紫斑牡丹目标性状的关联分析。关联分析能够有效地找到与紫斑牡丹表型性状紧密连锁的SSR标记,用于分子标记辅助育种。