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体外培养耳蜗毛细胞氧化应激损伤的微小RNA调控网络分析
体外培养耳蜗毛细胞氧化应激损伤的微小RNA调控网络分析
作者:
夏源
杨翠婵
王军义
王致
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
氧化性应激
毛细胞,听觉
高通量核苷酸测序
MicroRNA调控网络
摘要:
目的 通过体外培养耳蜗毛细胞氧化应激损伤的差异性微小RNA(microRNA,miRNA)构建的基因调控网络,分析耳蜗毛细胞氧化应激损伤的重要基因及功能,探讨以氧化损伤为基础的多种感音性聋的分子机制.方法 以200 μmol/L叔丁基双氧气水(tert butyl hydrogen peroxide,t-BHP)染毒培养的小鼠HEI-OC1细胞系构建氧化应激损伤耳蜗毛细胞模型,高通量sRNA测序筛选差异性miRNA,以6个差异性表达最显著的miRNA进行调控网络构建,分析miRNA调控网络互作关系里面的重要基因,并通过Gene Cards数据库对重要基因进行功能注释.结果 高通量sRNA测序发现氧化应激损伤毛细胞出现24个差异性miRNA,其中mir-1934(logFC=2.367 947,P=2.35×10-7)、mir-411(logFC=2.093 687,P=3.13×10-6)、mir-717(logFC=1.927 67,P=3.24×10-5)、mir-503 (logFC=-2.021 45,P =3.07×10-6)、mir-467e(logFC=-1.953 28,P =0.000 137)、mir-699o(logFC=-1.950 06,P=0.000517)差异最显著;构建的miRNA调控网络中相连基因个数超过50节点的重要基因共有11个:Akt1、Src、Ctnnb1、Creb1、Ccnd1、Egfr、Gsk3b、Pten、Cdh1、Fras1、Ccnd2,其主要功能体现在参与多种细胞内信号传导通路调控细胞的凋亡和增殖.结论 氧化应激损伤毛细胞有多种信号传导通路(PI3 K-AKT/PKB通路、AKT/PKB通路、Wnt通路、ERK通路、Ras通路)参与调控细胞增殖和凋亡过程,这些信号通路互相交联形成网络调控,其中PI3K-AKT/PKB信号通路最为重要.
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文献信息
篇名
体外培养耳蜗毛细胞氧化应激损伤的微小RNA调控网络分析
来源期刊
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志
学科
关键词
氧化性应激
毛细胞,听觉
高通量核苷酸测序
MicroRNA调控网络
年,卷(期)
2016,(10)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
751-755
页数
5页
分类号
字数
3987字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1673-0860.2016.10.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王致
广州市第十二人民医院职业卫生检测中心
7
39
4.0
6.0
2
王军义
广东药科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学系
11
14
2.0
3.0
3
夏源
广东药科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学系
4
8
2.0
2.0
4
杨翠婵
广东药科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学系
5
10
2.0
3.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
(19)
节点文献
引证文献
(6)
同被引文献
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二级引证文献
(3)
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引证文献(1)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
氧化性应激
毛细胞,听觉
高通量核苷酸测序
MicroRNA调控网络
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1673-0860
CN:
11-5330/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-68
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
6220
总下载数(次)
13
总被引数(次)
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中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2002
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2001
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2000
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志1999
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志1998
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第9期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第8期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第7期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第6期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第5期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第4期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第3期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第2期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第12期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第11期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第10期
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志2016年第1期
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