磁珠提取DNA改良法在HLA测序分型中的应用

• 作者: 夏家安 李王霞 马严
• 来源期刊: 临床血液学杂志（输血与检验版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 脱氧核糖核酸 标本 基因分型 测序分型
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 278-280
• 页数: 3页
• 分类号: Q343.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13201/j.issn.1004-2806-b.2016.04.005

摘要

目的:建立并改良磁珠提取基因DNA的方法,以应用于HLA常规测序分型.方法:使用磁珠法自动提取系统从全血中提取基因组DNA,利用DNA定量仪测定DNA浓度与纯度,利用测序仪对PCR扩增产物进行测序及相关的分析软件进行HLA分型结果分析.比较改良前后DNA浓度与纯度、HLA分型结果成功率、信噪比及测序胶图的反应格局.结果:改良后96份DNA浓度的均一性、纯度均优于改良前;32份HLA分型结果中HLA-A、B位点成功率改良后高于改良前,差异有统计学意义(P＜0.01);改良后32人份HLA-B第二外显子信噪比(N/S)合格率均高于改良前,差异有统计学意义(P＜0.01);改良后32份分型胶图反应格局均优于改良前.结论:改良磁珠提取DNA法能稳定、可靠地应用于HLA测序分型,具有快速、高通量化的特点和广泛的应用前景.