单核苷酸多态性(SNP)在近交系小鼠遗传检测中的应用

• 作者: 张蓉 赵丽亚 赵莹 邢正弘 陈国强
• 来源期刊: 实验动物与比较医学
• 学科: 生物学
• 关键词: 遗传质量检测 近交系小鼠 单核苷酸多态性(SNP) 多重聚合酶链反应和链接酶反应(PCR-LDR) 分型方案
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 24-31
• 页数: 8页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 2906字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-5817.2016.01.005

摘要

目的 利用单核苷酸多态性(SNP)位点构建多重聚合酶链反应和链接酶反应(PCR-LDR)方案,为近交系小鼠的遗传检测提供一种快速、简便的方法.方法 在SNP公共数据库中挑选51个SNP位点,该51个位点分布于每条常染色体和性染色体,共分为5组,进行多重PCR-LDR方案构建,并将该方案作为遗传质量检测方法对采集的7个近交系样本进行检测.结果 在送检的7个近交系小鼠样本中,纯合度都为100％,相同来源相同品系小鼠的遗传背景一致,但在不同单位的近交系小鼠中,某些SNP位点有差异,CBA/Ca/BK1和CBA/JSlac在a9、a10、b5、b9、c1、c12、e1、e2位点的遗传检测结果不同,C57BL/6/BK1和C57BL/6JS1ac在c7、c10位点的遗传检测结果不同.另外,两家公司各有5个位点在所有品系中基因型相同,因此有效位点数各为46个.结论 构建的多重PCR-LDR方案能有效对两家动物生产单位的近交系小鼠进行检测,可用于常见近交系小鼠快速、高通量的基因分型,有利于大规模遗传质量检测和品系鉴定.