单核苷酸多态性位点法对国内近交系小鼠遗传检测

• 作者: 刘丽均 刘欣 吕建祎 李银银 李长龙 杜小燕 郭萌 陈振文
• 来源期刊: 实验动物与比较医学
• 学科: 生物学
• 关键词: 近交系小鼠 单核苷酸多态性(SNP) 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS) 遗传检测
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 页码范围: 16-21
• 页数: 6页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 3547字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-5817.2018.01.003

摘要

目的 利用95个单核苷酸多态性位点 (SNP) 对29个品系共36个不同群体来源的近交系小鼠进行遗传检测,并分析、鉴别不同品系的位点.方法 对来自国内各地的C57BL/6J、BALB/c等36个群体近交系小鼠样品提取DNA后,选取参考自国内外文献的95个SNP位点,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF-MS) 技术对这些样品进行等位基因型分型,并两两比较等位基因型不同的位点数目.结果 共有29个群体 (80.56％) 的小鼠在95个SNP位点中成功进行了基因分型,有个别群体因为样品质量原因没有实现全部成功分型,主要集中于BALB/c相关背景的3个群体小鼠.被检品系中,大部分位点为纯合位点,品系内位点单态率最高为98.95％.群体两两比较显示,差异等位基因型最多的位点数达到58个,最少的只有1个,主要分布于同一品系不同群体来源的动物间及基因修饰动物和背景动物间.结论 所选SNP位点可用于近交系小鼠遗传检测和品系鉴别,但SNP用于近交系遗传检测仍应优化出可代表每一个近交系品系特征的SNP位点组合.