草莓叶片中5种新microRNA的RT-PCR鉴定及靶基因分析

• 作者: 张志宏 张馨宇 戚华彩 李贺 董向向
• 来源期刊: 沈阳农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 miRNA 前体 靶基因 功能分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 141-147
• 页数: 7页
• 分类号: S663.9
• 字数: 4475字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1700.2016.02.003

摘要

microRNA (miRNA)是来自真核生物自身基因组的非编码小分子RNA,在转录后水平上负调控基因表达,在植物的生长发育和胁迫应答等方面起重要作用.以栽培草莓艳丽为试材,利用RT-PCR技术克隆草莓叶片中5种新miRNA的前体及靶基因,分析靶基因的结构特征与功能,结果表明:草莓miR-6,miR-12,miR-13,miR-14,miR-29的前体长度分别为513 bp,309 bp,464bp,334 bp和343 bp,均能形成典型的茎环结构,其中miR-12、miR-13的成熟miRNA序列在茎环3'端臂上,miR-6、miR-14、miR-29成熟miRNA序列在茎环的5'端臂上.miR-14与miR-29的靶基因分别为854bp和690bp,与森林草莓基因组对应序列一致性为98.72％和99.42％,其中miR-29靶基因是GRP基因,编码143个氨基酸,推测miR-29靶基因在草莓植株的胁迫响应中有重要调控作用.本研究丰富了草莓miRNA的研究,为揭示草莓miRNA的生物学功能奠定基础.