花生SSR核心引物筛选及育成品种DNA指纹图谱构建

• 作者: 万丽云 任小平 周小静 晏立英 郑艳丽 陈伟刚 陈玉宁 雷永 黄莉
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 花生 SSR荧光标记 毛细管电泳技术 指纹图谱
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 563-571
• 页数: 9页
• 分类号: S565.203
• 字数: 6697字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2016.05.004

摘要

根据SSR引物在遗传连锁图上的位置,首先选择200对均匀分布在染色体上,且通过聚丙烯酰胺凝胶电泳银染技术筛选表现为条带清晰、可重复的单位点引物,再利用毛细管电泳技术筛选等位变异数≥4个、引物的PIC值≥0.4、杂合度≤0.1的引物,并参考其所在染色体位置,获得60对具有丰富的多态性、广泛的代表性、均匀分布的SSR引物,同时普通引物和荧光引物都具有较好的扩增效果,作为花生品种构建指纹图谱的核心引物.60对SSR引物在100份材料中共扩增出352个多态性等位位点,引物扩增的等位位点均值为5.87;每对引物可区分的基因型数目均值是6.35;引物的多态性信息指数(PIC值)均值是0.54.高多态性的SSR引物占66.67％,SSR引物杂合度都在0.06以下.品种间的遗传相似系数变幅为0.530～ 0.683.构建了100份花生的指纹图谱,每一条指纹都具有唯一性,可标识一个品种,为全国花生品种及资源的DNA指纹数据库的构建奠定基础.