普通荞麦种内丝裂原活化蛋白激酶序列分析

• 作者: 孟子烨 梁成刚 石桃雄 陈其皎 陈庆富 陈晴晴
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 普通荞麦 丝裂原活化蛋白激酶 序列分析 氨基酸位点 蛋白结构
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 页码范围: 90-96
• 页数: 7页
• 分类号: S517|S321
• 字数: 3990字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2016.04.015

摘要

【目的】比较普通荞麦Fagopyrum esculentum种内丝裂原活化蛋白激酶基因( MAPK)序列的差异,研究MAPK基因序列在普通荞麦栽培进化过程中的变化。【方法】以普通荞麦的9个栽培品种和3个落花落果野生种质为材料,PCR特异性扩增获得MAPK基因的保守片段,对基因片段序列进行差异分析和蛋白结构预测。【结果】荞麦MAPK基因cDNA全长为2835 bp,开放阅读框1827 bp,编码609个氨基酸,含有TDY的三肽模块,为植物D组MAPK蛋白。 PCR扩增获得12个供试材料的MAPK序列,其单型不变位点为723个,多态位点为70个。9个栽培品种间开放阅读框( ORF)区域无序列差异,3个野生种质间ORF区域也无序列差异。栽培品种与野生品种的ORF区域序列含有8个差异位点,编码3个差异氨基酸。其中,ORF区域第13位点组氨酸( H)→酪氨酸( Y)发生置换,导致1个α-螺旋构象发生变化。【结论】普通荞麦MAPK基因序列高度保守,栽培驯化对ORF区域第13位点差异氨基酸的选择具有高度一致性。