基于高通量测序的陕西花马池和苟池微生物群落多样性分析

• 作者: 严雨薇 徐方敏 曹露芬 殷婷婷 温洪宇 袁振亚 许心怡 谢凡凡
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 细菌 古菌 高通量测序 盐湖 16S rDNA
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 374-380
• 页数: 7页
• 分类号: Q938
• 字数: 3733字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2016.03.017

摘要

目的:研究陕西花马池和苟池盐湖嗜盐细菌和古菌的群落多样性特征.方法:从两地盐湖采集卤水样品,提取总DNA后对其16S rRNA基因进行PCR扩增,通过Miseq高通量测序和生物信息学分析得到花马池和苟池微生物群落结构.结果:细菌优化序列被分入222个操作分类单位(OTU),花马池细菌优化序列经筛选后得到26 698个序列,其中厚壁菌门(Firmicutes)占主要地位,占总序列数的24.13％,其次20.02％的序列归入变形菌门(Proteobacteria);苟池细菌优化序列经筛选得到31 329个序列,拟杆菌门(Bacteroidetes)是样品中最主要的门类,占总数的60.56％.古菌优化序列经筛选后有81 286条,被归入86个OTU中,绝大多数属于广古菌门(Euryarchaeota).在属水平上,2个盐湖共有的优势古菌群落包括Halonotius、盐红菌属(Halorubrum)、盐杆状菌属(Halorhabdus)和Halobellus等.花马池特有Halolamina、盐杆菌属(Halobacterium)、Halobellus和Halovenus.结论:研究揭示了陕西花马池和苟池嗜盐细菌和古菌群落组成,表明陕西花马池和苟池盐湖微生物群落分布具有相似性和独特性,同时存在丰富的嗜盐菌资源和潜在的新类群,为新种的挖掘及嗜盐菌的开发提供了理论数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	殷婷婷	江苏师范大学生命科学学院	9	29	3.0	5.0
2	温洪宇	江苏师范大学生命科学学院	32	93	6.0	7.0
3	袁振亚	江苏师范大学生命科学学院	7	38	3.0	6.0
4	曹露芬	江苏师范大学生命科学学院	2	14	2.0	2.0
5	严雨薇	江苏师范大学生命科学学院	1	11	1.0	1.0
6	谢凡凡	江苏师范大学生命科学学院	1	11	1.0	1.0
7	许心怡	江苏师范大学生命科学学院	1	11	1.0	1.0
8	徐方敏	江苏师范大学生命科学学院	1	11	1.0	1.0