可可核心种质遗传多样性及果实性状与SSR标记关联分析

• 作者: 伍宝朵 李付鹏 秦晓威 赖剑雄 郝朝运 闫林
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 可可 SSR 遗传多样性 关联分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 作物栽培与营养、遗传育种
• 页码范围: 226-233
• 页数: 8页
• 分类号: S571.3
• 字数: 4187字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2016.02.003

摘要

利用15对SSR引物,分析具有广泛来源的70份可可资源的遗传多样性.结果表明,15对引物共扩增出76个条带,其中50个多态性条带,占总带数的65.8％.70份可可资源间遗传相似系数(SM)在0.341 ～0.943之间,平均值为0.625,说明可可资源具有丰富的遗传多样性.在相似系数为0.65水平上,可将70份可可资源分成10类.利用Structure 2.3.2软件分析群体结构,结合可可果实相关性状的表型数据,采用Tassel 2.1的一般线性模型(General linear model,GLM)进行关联分析;结果表明18个位点与果重、果壳重、果长、果径围、果壳厚显著相关(p＜0.05),各位点对表型变异贡献率为5.5％～13.1％.