绿豆SSR标记的开发及遗传多样性分析

• 作者: 叶卫军 陈圣男 杨勇 张丽亚 田东丰 张磊 周斌
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 绿豆 测序 SSR 引物设计 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1176-1188
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.84155

摘要

SSR标记以其数量丰富、多态性好、共显性遗传等优点在基础研究和育种工作中发挥了重要作用，但目前绿豆基因组中的SSR标记依然较少。本研究将磁珠富集法和测序技术相结合高通量检测绿豆基因组SSR位点，鉴定出3，275，355个SSR位点，开发了2742个SSR标记。选取其中157个SSR进行PCR验证，发现有90个(57.33%)标记在10份材料中表现出多态性。挑选40个条带清晰、多态性高、染色体上均匀分布的标记对90份绿豆资源进行遗传多样性分析，单个位点检测到的等位变异数为2~8个，平均为3.0个，有效等位基因数为1.31~4.21个，平均为2.16。Nei’s基因多样性指数在0.23~0.76之间，平均为0.51。多态性信息含量为0.22~0.72，平均为0.43。聚类分析将90份材料分为2个类群，包含4个组。第I组主要由北方资源组成，第II组种质来源较为分散，第III组主要由山东的资源构成，第IV组包含多数河北的种质资源。本研究开发的多态性SSR标记不仅可以用于绿豆种质资源的遗传多样性分析，也将在高密度遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种中发挥重要作用。