豚鹿SSR标记开发与遗传多样性分析

• 作者: 耿广耀 由玉岩 刘群秀
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 豚鹿 微卫星 分子标记开发 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2023,（3）
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.12375/ysdwxb.20220329

摘要

以上海动物园圈养豚鹿(Axis porcinus)日常体检中抽取的血液为试验样品提取总DNA,利用高通量测序技术对通过探针富集得到的SSR序列测序,并用MISA检索SSR标记.结果表明:单碱基重复SSR到六碱基重复SSR在豚鹿基因组中均有分布,其中双碱基重复占比最高,在双碱基重复中以AC/GT重复为主.本研究成功开发出7个SSR标记,这些标记在22只豚鹿个体中检测到等位基因2～5个,在豚鹿种群中的平均多态信息含量(PIC)为0.421,平均期望杂合度(He)为0.513.7个SSR标记中有3个高度多态标记、3个中度多态标记和1个低度多态标记,可用于豚鹿的遗传多样性研究.