2012年深圳地区轻重症手足口病患者肠道病毒71型VP1~VP4区基因特征分析

• 作者: 何雅青 姚相杰 张仁利 王汉中 程锦泉
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 手足口病 肠道病毒71型 序列分析 基因型 变异
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 171-176
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2016.03.003

摘要

目的 了解2012年深圳地区手足口病重症和轻症患儿肠道病毒71型(EV71)分离病毒株VP1~VP4区的基因特征.方法 对来自2012年深圳地区重症与轻症手足口病患儿(各5株)EV71分离株进行VP1~VP4区全序列RT-PCR扩增和测序,并与美国国立生物技术信息中心公布的EV71 A、B、C基因型代表株进行核苷酸、氨基酸比对分析和系统进化分析.结果 轻、重症患儿的EV71分离株之间VP1~VP4基因的核苷酸同源性为95.1%~98.2%;氨基酸同源性为99.2%~100%.轻、重症患儿的EV71分离株与C基因型代表株比较接近,VP1~VP4区核苷酸同源性分别为87.9%~97.8%,氨基酸同源性分别为97.3%~99.9%,其中与2008年安徽省阜阳市的EV71流行株和江西省景德镇市重症株(C4a亚型)VP1~VP4区核苷酸同源性最高,进化关系最近.同时发现3例重症患儿分离株均在VP1区出现N31 D的变异.结论 2012年深圳地区10例轻、重症手足口病患儿中分离的EV71流行株均属C基因型的C4a亚型;EV71病毒株VP1区N31D的氨基酸突变可能与深圳地区手足口病患儿的临床表现差异有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张仁利	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	192	798	13.0	17.0
2	程锦泉	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	115	783	14.0	20.0
3	何雅青	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	53	626	13.0	23.0
4	姚相杰	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	29	244	8.0	14.0
5	王汉中	中国科学院武汉病毒研究所	14	90	5.0	9.0