全基因组分析单核苷酸多态性对多聚腺苷化信号的影响

• 作者: 吉国力 吴小惠 黄蓉婷
• 来源期刊: 生命科学仪器
• 学科: 生物学
• 关键词: 单核苷酸多态性 多聚腺苷化 EST
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 38-41
• 页数: 4页
• 分类号: Q-332
• 语种: 中文
• DOI: 10.11967/2016140608

摘要

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,是人类可遗传的变异中最常见的一种.多聚腺苷化(polyadenylation,poly(A))是真核生物基因表达的一个重要步骤,对mRNA从细胞核输出及翻译过程起重要作用.Poly(A)位点的有效剪切、转录终止及翻译终止都跟poly(A)信号(poly(A) signal,PAS)密切相关.研究表明一些poly(A)信号上的碱基突变能够影响poly(A)位点的选择,即单核苷酸多态性能产生、改变或消除目前已被发现的PAS,从而导致poly(A)位点的差异性选择.本文对已发现的保守性排名前50的PAS进行分类,并从全基因组层面分析了SNP对于PAS的不同改变形式,筛选能改变PAS的SNP.为了分析SNP是否影响转录本长度,本文将SNP和EST比对到基因组上,筛选包含SNP的EST,最终筛选出能改变EST长度的SNP,说明了SNP可以通过改变PAS的形式来影响poly(A)位点的选择,进而影响转录本长度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吉国力		44	259	9.0	14.0
2	吴小惠		2	0	0.0	0.0
3	黄蓉婷		1	0	0.0	0.0