甘蔗花叶病毒（SCMV）种群结构分析

• 作者: 徐景升 成伟 杨永庆 程光远 翟玉山 邓宇晴 郑艳茹
• 来源期刊: 《福建农林大学学报（自然科学版）》
• 关键词: 甘蔗花叶病毒 种群结构 选择压力
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 135-140
• 页数: 6页
• 分类号: Q931
• 语种: 中文
• DOI: 10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2016.02.003

摘要

针对已公布的18个甘蔗花叶病毒( SCMV)全基因组序列,利用MEGA 5.1分析了其11个蛋白( P1、HC-Pro、P3、6K1、CI、6K2、VPg、NIa-Pro、Nib、CP-C和多聚蛋白)编码基因所受的选择压,并结合其编码蛋白的功能,预测了部分基因在SCMV进化过程中的角色和变异位点.结果显示：P1和CP-N端的变异性程度较大,P1蛋白多样性最高；CP-C端变异性和多样性均较低；PIPO受到的选择压最小,但多样性最低,可能是由于PIPO与P3共用一段编码序列.来源于甘蔗的SCMV多聚蛋白的第2853、2897和2904个氨基酸位点(在CP中部)分别为T、R和E,而来源于玉米的SCMV多聚蛋白对应的氨基酸位点分别为S、K和D,表明这3个位点具有寄主依赖性.