2-型猪链球菌保护性抗原ESA的细胞定位及B细胞表位预测

• 作者: 刘丽娜 周静 张洁 王赟 钟乃凤
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 2-型猪链球菌 ESA 细胞定位 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 页码范围: 69-73
• 页数: 5页
• 分类号: S852.611
• 字数: 1839字
• 语种: 中文

摘要

通过生物信息学方法预测2-型猪链球菌（Streptococcus suis serotype 2，SS2）保护性抗原ESA（epidermal surface antigen, ESA）在SS2中的分布和B细胞表位，为研究SS2的多表位疫苗奠定基础。以ESA推定的氨基酸序列为基础，通过生物信息学软件对ESA进行信号肽、跨膜序列等分析，然后分别以Kyte-Doolittle法、Emini法和Jameson-Wolf法分析蛋白的亲水性、表面可能性以及抗原指数；辅以Garnier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus-Schulz法分析蛋白二级结构中柔性区域，进而预测ESA的B细胞表位。结果表明，ESA为跨膜蛋白，B细胞表位位于N-端第30~35、59~64、178~185、245~253区域。多参数或多个软件联合使用能预测SS2保护性抗原ESA的B细胞表位和细胞定位，为实验研究提供帮助，大大缩减实验时间。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟乃凤	贵州医科大学生物与工程学院	7	1	1.0	1.0
2	周静	贵州医科大学生物与工程学院	17	19	3.0	4.0
3	刘丽娜	贵州医科大学生物与工程学院	17	17	2.0	3.0
4	张洁	贵州医科大学生物与工程学院	24	33	3.0	5.0
5	王赟	贵州医科大学生物与工程学院	18	16	2.0	2.0