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摘要:
目的:通过对已公开基因芯片表达谱数据进行研究,探究正常及退变椎间盘组织间的基因表达差异,并对差异表达基因所涉及的生物学过程进行预测分析。方法经GEO数据库选取与椎间盘退变相关的基因芯片表达谱数据GSE23130,对GSE23130包含的样本数据进行质量分析,选取GSM569833等10例样本数据纳入实验。采用GeneSpring 13.0软件对正常及退变样本间差异表达基因进行筛选,针对差异表达基因构建聚类分析树及热图,并采用GO分析、KEGG PATHWAY分析及DAVID功能注释簇集分析等方法对差异表达基因进行生物信息学分析。结果筛选出差异表达基因3182个,其中1735个基因在退变椎间盘内表达上调,1447个表达下调。针对差异表达基因进行的生物信息学分析发现了VEGF信号通路、激活T细胞的核因子等数个存在研究价值的生物学过程。结论本研究结果显示椎间盘退变过程中存在大量基因的异常表达,这些差异表达基因相关的生物学过程也出现明显异常,某些生物学过程的异常改变可能在椎间盘退变过程中扮演了重要角色。
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文献信息
篇名 椎间盘退变相关的基因芯片表达谱数据研究
来源期刊 海南医学 学科 医学
关键词 椎间盘退变 纤维环 基因芯片 生物信息学
年,卷(期) 2016,(6) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 870-873
页数 4页 分类号 R681.5+3
字数 3339字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1003-6350.2016.06.004
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李放 北京军区总医院骨科 149 1171 18.0 26.0
2 赵广民 北京军区总医院骨科 44 342 11.0 16.0
3 单建林 北京军区总医院骨科 51 340 12.0 15.0
4 任大江 北京军区总医院骨科 36 274 9.0 15.0
5 万中元 北京军区总医院骨科 4 16 2.0 4.0
6 宋芳 第二炮兵总医院口腔科 2 4 1.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
椎间盘退变
纤维环
基因芯片
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
海南医学
半月刊
1003-6350
46-1025/R
大16开
海南省海口市海府路69号艺苑大厦702房
84-1
1973
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