单核苷酸多态性JSON文件的转换

• 作者: 王潘章
• 来源期刊: 北京生物医学工程
• 学科: 医学
• 关键词: 单核苷酸多态性 JSON Node.js 文件转换
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 技术交流
• 页码范围: 294-296
• 页数: 3页
• 分类号: R318|TP39
• 字数: 1385字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-3208.2016.03.14

摘要

目的 对SNP原始文本格式转换成规范JSON格式,便于计算机软件分析人类的基因.方法 利用Node.js流函数pipe对庞大的SNP原始文本文件进行分段读取进内存并转换成规范的JSON格式,最后分段地写入到一个最终结果文件中去.结果 针对不同基因测序厂商提供的检测结果,提供了一种相对规范的JSON格式,开发出了转换工具包.结论 采用JSON文件格式可以较好、较简单地对多厂商的SNP原始文本文件进行规范的表达,使用Node.js开发的转换工具效率较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王潘章		4	17	1.0	4.0