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摘要:
[目的]为了解湖羊和巴什拜羊骨形态发生蛋白15 (BMP15)基因编码区和5’调控区(5'UTR)序列特征与差异,检测其SNPs(single nucleotide polymorphisms)并探索其功能.[方法]利用克隆测序技术获得湖羊和巴什拜羊BMP15基因编码区和5'UTR序列,运用生物信息学方法分析其序列特征;采用DNA池测序法筛选湖羊和巴什拜羊BMP15基因SNPs,直接测序法检测SNPs位点多态性;采用荧光素酶报告基因系统检测启动子区活性.[结果]湖羊和巴什拜羊BMP15基因编码区序列长度均为1 182 bp,编码393个氨基酸,编码蛋白含有典型的TGF-β结构域;湖羊和巴什拜羊BMP15基因编码区序列的同源性为99.92%,发现1个SNP位点.获得1 806 bp湖羊和巴什拜羊BMP15基因5’调控区序列,发现5个SNPs位点.BMP15基因c.-1760C>A位点多态性分析发现湖羊群体中均为CC基因型,巴什拜羊群体中有CC、CA和AA 3种基因型,等位基因C和A频率分别为0.798 1和0.2019.启动子区活性检测显示CC型启动子区活性明显高于AA型.[结论]湖羊和巴什拜羊BMP15基因编码区序列高度保守,c.-1760C>A变异可能影响BMP15基因启动子区活性.
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文献信息
篇名 湖羊和巴什拜羊BMP15基因c.-1760C>A变异与启动子区活性的关系
来源期刊 南京农业大学学报 学科 农学
关键词 BMP15基因 湖羊 巴什拜羊 SNPs 启动子区活性
年,卷(期) 2016,(4) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 632-639
页数 分类号 S826
字数 语种 中文
DOI 10.7685/jnau.201509030
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李齐发 南京农业大学动物科技学院 51 685 17.0 25.0
2 潘增祥 南京农业大学动物科技学院 15 99 4.0 9.0
3 王德迪 南京农业大学动物科技学院 3 2 1.0 1.0
4 金雯雯 南京农业大学动物科技学院 1 2 1.0 1.0
5 决肯 新疆农业大学动物科学学院 5 7 2.0 2.0
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湖羊
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启动子区活性
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南京农业大学学报
双月刊
1000-2030
32-1148/S
大16开
南京市卫岗1号
28-53
1956
chi
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